如果对经营用的房屋进行拆迁的，并且房屋的产权是经营用的，拆迁时是有停产停业损失补偿的。

对土地进行征收时，征收土地的补偿包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费。

农村房屋征收的补偿标准包括如下：

1、被征收房屋价值的补偿;

2、房屋征收引起的搬迁，临时安置补偿;

3、补偿因房屋征收造成的停产停业损失。根据法律相关规定，征地公告时，已取得建房批准文件且新房已建造完毕的，对新房予以补偿，对应当拆除而未拆除的旧房应予补偿，个人的物权任何人不能侵犯，征地公告时，已取得建房批准文件但新房尚未建造完毕的，应当立即停止建房，具体补偿金额可以协商议定。

(1)房屋价值补偿标准

这里的房屋补偿，是指对被征收的国有土地上建筑物价值进行的补偿，按不低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似的市场价格，并请有评估资质的评估机构进行评估确定。这里的市场价格，地级市政府部门都会依据每年住宅房屋市场价格规律，制定出相应房屋市场价格表供当地被拆迁的居民进行参考。如：石家庄市人民政府针对三年大变样政策，每年都出具了《石家庄拆迁区域住宅房屋市场价格表》。不清楚自己区域被拆迁房屋的价格的，可以找当地政府建设部门进行咨询或索取材料。对评估确定房屋价值有异议的，可以向复核评估，对复核结果有异议的，可以向评估专家委员会申请再次鉴定。

(2)搬迁费和临时安置费(俗称过渡费)

搬迁费和临时安置费用，具体数额各市一般都已确定具体数额及计算方式，详见各地出具标准，在这里作者所列算的补偿标准，是以大众化被拆迁人自主搬迁和过渡方式进行的计算。如果拆迁人提供周转房，则无需支付临时安置费。以石家庄为例(自主搬迁)：2012年搬迁费20元/平方米，按2次计算;临时安置费(过渡费)按25元/平方米计算，逾期12月以内，每月增加50%，预期12个月不满24个月的，自第13个月起每月增加75%，逾期24个月以上的，自第25个月起每月增加100%。(具体以当地政府政策为准)

(3)停产停业损失的补偿

该费用针对非住宅类房屋运营性房屋进行补偿，因为属个案，补偿标准不能统一，一般是有征收当事人进行协商确定，协商不成的，可委托房地产价格评估机构评估确定。

(4)补助和奖励

补助包括困难补助和公摊补助。困难补助是针对贫困人员进行的补助，依据当地政府出具的标准确定;公摊补助针对所有被拆迁人的房屋公摊进行的额外补助，也会出具公摊补助标准。

在司法实践中，对于征地补偿的项目和标准应当由政府部门来制订，对于征地行为的确定应当由政府处理，其它个人或者单位都是无权进行认定的，具体情况下应当结合实际情况来处理，避免在法律适用的过程中，因补偿标准不合理而导致矛盾。

需要注意的是，在我国的土地征收的补偿的规定中，如果是用作经营性质的房屋、土地被征收的，此时在行政机关对该房屋或者是土地征收的时候，是需要对其停产停业的损失予以补偿的，如果是不补偿的，此时被征收人是可以通过申请行政复议和行政诉讼来维权的。