黄瓜苗期容易发生沤根，表现为根部不发新根而腐烂，叶片发黄、焦枯。另外还易发生僵苗，表现为叶小，根少。发生沤根的原因是地温低，土壤湿度大，土壤缺氧，根系处于不适宜的环境条件下而形成根系受损，也就是当温度长期处于10℃以下，土壤持水量大于25%时，土壤相对湿度高于75%，这时候根系活动能力降低，而发生沤根。据调查，连阴天时夜间棚室温度仅在3-7℃，根系处于低温的不适宜环境中。

僵苗的原因主要是蔬菜苗长期处于低温环境，据调查，上年12月至翌年1月连阴天时，没有加温的棚白天室温仅6-7℃。虽然没有死亡，但植株也停止生长。

解决的方法是：提高育苗棚的温度，可采用地热线、灯光、小拱棚等方式提温。另外叶面喷芸薹素内酯6000倍液，或爱多收6000倍液和核苷酸叶肥400倍液，以促进根的生长，使苗的生长恢复正常。