潜伏感染是指机体存在病毒核糖核酸（DNA)，但是并未产生子代病毒的状态。在潜伏期，病毒基因组仅转录其中特定的一部分基因组，这一时期称为潜伏相关转录期。潜伏感染的伪狂犬病病毒具有激活和排毒的潜能。绝大多数处于潜伏感染的猪通常无症状，是病毒持续携带者，是潜在的传染源。潜伏感染持续达170?210天，如有免疫抑制可持续到18个月，有的终身带毒，具有持久的危险性。当带毒猪遭受应激（如感染其他疾病、注射疫苗等），免疫力降低时，则病毒可以恢复复制而发病，并排毒感染健康猪。所以，不要以为只要注射了疫苗即可防制此病。这也是成功控制和根除伪狂犬病的困难所在。