在四十年代以前，中统的势力非常大，因为实际上国民党的各级基层党组织，都是中统的特务网延伸。许多基层党部的负责人，本身就是中统的基层负责人。

抗战以后，由于国民党的情报工作对象有所改变，从以对付中国共产党向对付日本侵略转变，因此中统的地位开始下降，而军统的地位不为提升。

同时，由于大片国土沦陷，中统的组织系统严重破坏，而其又不能及时的联络这些基层组织。逐渐为军统所取代。

加之军统头子戴笠对蒋有知遇之恩和师生之情，对蒋言听计从。而中统主要为国民党CC系的大老陈立夫、陈果夫叔侄所掌握，在人事上蒋不能直接控制，也逐渐失去了蒋的扶持。到了国民党退台后，中统实际上已经丧失了全部组织系统。而军统的组织系统倒是得以保存和发展。由于中统与军统在争夺秘密工作的主导权上，进行了长期的明争暗斗，双方的合作非常有限,甚至到了水火不容的地步。

中统局全称中国国民党中央执行委员会调查统计局，简称中统。电视剧上那种证件封皮上印“中统”二字是不对的，而且大小尺寸也差好多。中统成立基础是陈果夫、陈立夫兄弟为首的CC系分子掌控的国民党中央组织部党务调查科，科长徐恩曾。

军统局全称国民政府军事委员会调查统计局，简称军统。军统的成立基础是中华复兴社特务处。1932年4月1日，蒋介石命令戴笠组建该处，并担任处长，戴笠属黄埔系军人派，该处一直是一个独立的系统。

同年，又成立了国民政府军事委员会调查统计局，由戴笠兼任调查局第二处（特务处）处长。1934年7月，戴笠继邓文仪任南昌行营调查科（特务科）科长。1935年初，调查科并入军事委员会调查统计局第二处。

中统主要是由陈果夫，陈立夫家族掌控，是CC派的天下。在抗战后期他们几乎控制了国党，当时有句话说“蒋家天下陈家党”。和其他派系（桂系，马家军等等）不同，中统没有地盘和军队，地位主要依靠政治和排挤其他中央派系来维持。

当时中央的派系有许多，除了军统之外还有三青团，复兴社等等，还有一些动不得的，比如四大家族里的蒋家，宋家和孔家。中统利用其势力在抗战前后逼死了三青团和复兴社，但是军统因为其重要性一直没能被中统所排挤掉。

蒋介石精于权术，明白中统和军统相互牵制，才能让他容易掌控，对许多矛盾睁一只眼闭一只眼，根本不想化解，这也是中统和军统纷争不断的一大原因。