1、常温保存。将剥开的菠萝蜜包上保鲜膜，然后放在放有竹叶、碎纸或蕉叶的竹筐或纸盒中，并放置阴凉通风处即可。存放时要注意好温度和湿度，一般情况下，存放温度保持在11～13度左右，湿度在85～95%条件下最好，这种可存放5～7天左右。

2、制成菠萝蜜干。用烤箱或者微波炉，小火慢烤，中途翻面，逐渐烘干水分即可，这样加工出的菠萝蜜干，可以放很久的。

3、冰箱保存。连皮放冰箱，封上保险膜，5天之内最好吃完，5天以后吃不完最好扔掉，它会发酵的。

4、盐水保存。菠萝蜜个头很大有些人打开它以后，一次吃不完，这时要以取少量的食用盐，加入清水制成淡盐水，然后把菠萝蜜的果肉放入到盐水中浸泡，再把它们存入冰箱，可以保存两天左右。