1、花纹不同：花栗鼠背部中间有一条黑色的条纹一直到尾巴，是由褐色、灰白、以及黄白色三种颜色相间的条纹。而松鼠只有条纹松鼠才有纹路色彩，且只有黑色和灰白两种颜色，而最明显的就是松鼠的大尾巴。

2、体型不同：花栗鼠的个头比松鼠要小很多，并且它们的体重大约都在100克左右，成鼠体长在11~15厘米左右。而松鼠体重大约在300~400克之间，体长在20~20厘米左右。

3、习性不同：花栗鼠一般在地面活动，极少数会在树上，而松鼠多时间在树上生活，只有在严寒天气才会减少活动。而它们冬天的时候都会储存食物，并通过睡觉来度过寒冷的冬天。